Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHBP07195 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHBP07195 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms