Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms