Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEBLO76041 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms