Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPLO60437 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPLO60437 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPLO60437 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPLO60437 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPLO60437 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPLO60437 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPLO60437 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPLO60437 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPLO60437 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPLO60437 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms