Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms