Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMC8O43402 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms