Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms