Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KR12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KR12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KR12 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KR12 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms