Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms