Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC69A6NI79 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms