Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms