Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms