Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC196A0A1B0GTZ2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC196A0A1B0GTZ2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms