Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTNQ9Y639 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTNQ9Y639 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPTNQ9Y639 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms