Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX8Q9Y5X2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX8Q9Y5X2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX8Q9Y5X2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms