Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RAPGEF2Q9Y4G8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAPGEF2Q9Y4G8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
RAPGEF2Q9Y4G8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAPGEF2Q9Y4G8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.35
RAPGEF2Q9Y4G8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms