Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRELID3BQ9Y3B1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRELID3BQ9Y3B1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms