Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
THRAP3Q9Y2W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
THRAP3Q9Y2W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
THRAP3Q9Y2W1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
THRAP3Q9Y2W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
THRAP3Q9Y2W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
THRAP3Q9Y2W1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms