Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BTRCQ9Y297 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BTRCQ9Y297 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BTRCQ9Y297 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BTRCQ9Y297 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms