Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA2Q9UQC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA2Q9UQC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA2Q9UQC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA2Q9UQC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCA2Q9UQC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms