Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COG5Q9UP83 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG5Q9UP83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG5Q9UP83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG5Q9UP83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms