Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1LQ9UNN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms