Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PADI4Q9UM07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI4Q9UM07 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI4Q9UM07 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 601.3 ms