Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND3Q9UK17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND3Q9UK17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCND3Q9UK17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND3Q9UK17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms