Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED13Q9UHV7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED13Q9UHV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13Q9UHV7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms