Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SRP68Q9UHB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRP68Q9UHB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SRP68Q9UHB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SRP68Q9UHB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRP68Q9UHB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SRP68Q9UHB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SRP68Q9UHB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SRP68Q9UHB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SRP68Q9UHB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms