Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT3BQ9UBC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT3BQ9UBC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT3BQ9UBC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms