Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP36Q9P275 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP36Q9P275 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP36Q9P275 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP36Q9P275 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms