Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0X4

CACNA1I, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1I, humanhuman

Predictions only

Length 2,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1IQ9P0X4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1IQ9P0X4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1IQ9P0X4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1IQ9P0X4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1IQ9P0X4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1IQ9P0X4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1IQ9P0X4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1IQ9P0X4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA1IQ9P0X4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1IQ9P0X4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms