Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNKQ9P0W0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNKQ9P0W0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms