Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCMF1Q9P0J7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCMF1Q9P0J7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCMF1Q9P0J7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms