Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CABP1Q9NZU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CABP1Q9NZU7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CABP1Q9NZU7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CABP1Q9NZU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CABP1Q9NZU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CABP1Q9NZU7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms