Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM260Q9NX78 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM260Q9NX78 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM260Q9NX78 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM260Q9NX78 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM260Q9NX78 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM260Q9NX78 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM260Q9NX78 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM260Q9NX78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms