Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYARQ9NX58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LYARQ9NX58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYARQ9NX58 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms