Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARPBPQ9NWS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARPBPQ9NWS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARPBPQ9NWS1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms