Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLIMQ9NVW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLIMQ9NVW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms