Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVV0

TMEM38B, Trimeric intracellular cation channel type B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38BQ9NVV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38BQ9NVV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38BQ9NVV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38BQ9NVV0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM38BQ9NVV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM38BQ9NVV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms