Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBCCD1Q9NVR7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TBCCD1Q9NVR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TBCCD1Q9NVR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms