Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERINC1Q9NRX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERINC1Q9NRX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms