Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTPS2Q9NRF8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTPS2Q9NRF8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS2Q9NRF8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms