Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL1Q9NR64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL1Q9NR64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL1Q9NR64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms