Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPRD1BQ9NQG5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1BQ9NQG5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1BQ9NQG5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms