Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTN4Q9NQC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN4Q9NQC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN4Q9NQC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN4Q9NQC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms