Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CABP2Q9NPB3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CABP2Q9NPB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CABP2Q9NPB3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CABP2Q9NPB3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CABP2Q9NPB3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CABP2Q9NPB3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms