Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMX1Q9NP08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMX1Q9NP08 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMX1Q9NP08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMX1Q9NP08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HMX1Q9NP08 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMX1Q9NP08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMX1Q9NP08 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMX1Q9NP08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMX1Q9NP08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms