Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP4F12Q9HCS2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4F12Q9HCS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms