Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EBF2Q9HAK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF2Q9HAK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF2Q9HAK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms