Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOBPQ9H2D6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIOBPQ9H2D6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIOBPQ9H2D6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIOBPQ9H2D6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIOBPQ9H2D6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms