Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH19Q9H159 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CDH19Q9H159 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH19Q9H159 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH19Q9H159 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH19Q9H159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms