Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL1Q9H0R8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL1Q9H0R8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL1Q9H0R8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL1Q9H0R8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL1Q9H0R8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL1Q9H0R8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABARAPL1Q9H0R8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL1Q9H0R8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL1Q9H0R8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms